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刺五加ATP合酶β亚基基因的克隆与序列分析

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【作者】 曹蕾邢朝斌陈龙梁能松何闪

【Author】 CAO Lei et al (College of Life Science,Hebei United University,Tangshan 063000)

【机构】 河北联合大学生命科学学院

【摘要】 [目的]克隆刺五加叶绿体的ATP合酶β亚基cDNA并对其进行生物信息学分析。[方法]根据已知物种叶绿体ATP合酶β亚基基因的序列,设计1对同源引物,通过RT-PCR扩增得到刺五加ATP合酶β亚基cDNA,并对其进行序列比对及结构预测分析。[结果]RT-PCR扩增获得了长1 099 bp的刺五加ATP合酶β亚基cDNA,该基因编码366个氨基酸。序列比对及结构预测分析表明,刺五加ATP合酶β亚基基因编码的氨基酸与水稻的同源性最高,达96.41%。其二级结构中含有171个α螺旋(alpha helix),占46.72%;53个延伸链(extended strand),占14.48%;27个β折叠(beta turn),占7.38%;115个无规则蜷曲(random coil),占31.42%。第262~271位氨基酸为ATP合酶β亚基的标志性位点。整个多肽链无明显的疏水区域,初步认定为亲水性蛋白。[结论]该试验克隆得到的ATP合酶β亚基基因为叶绿体ATP合酶β亚基基因,为研究刺五加能量代谢对植物次生代谢的影响及了解植物ATP合酶的结构与功能提供了必要的信息。

【关键词】 刺五加ATP合酶β亚基克隆序列分析
【基金】 国家自然科学基金(30701086);河北省自然基金(C200-9001252)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2012年02期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.02.183
  • 【分类号】S567.19
  • 【被引频次】5
  • 【下载频次】159
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