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白藜芦醇处理乳腺癌细胞基因表达通路分析

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【作者】 丁华杰叶云高强钟英英

【Author】 DING Huajie;YE Yun;GAO Qiang;ZHONG Yingying;School of Biological and Chemical Engineering,Guangxi University of Science and Technology;

【通讯作者】 钟英英;

【机构】 广西科技大学生物与化学工程学院

【摘要】 为了研究白藜芦醇抗乳腺癌的作用机制,从GEO数据库获取用白藜芦醇处理过的乳腺癌的表达谱数据集(GSE25412),通过BRB软件包获取差异表达基因;对差异基因进行功能聚类和蛋白-蛋白相互作用分析,GSEA对乳腺癌进行基因集富集分析;最后通过CMAP对药物作用机制或药理作用进行预测.结果:通过对比白藜芦醇和乙醇作用于MCF7细胞基因表达谱,获得763个显著差异基因,其中上调基因262个,下调基因501个;GSEA主要富集到细胞代谢等18条与乳腺癌相关的信号通路;蛋白相互作用网络的分析结果显示:IFI44可能成为药物作用新靶点.CMAP分析结果显示:白藜芦醇的抗乳腺癌作用机制复杂,分析结果显示与激素作用、HDAC抑制剂、hsp90抑制剂、PI3K抑制剂等有关.研究结果表明:基于基因表达谱的乳腺癌组织与正常组织的筛选比对,为抗肿瘤药物发现提供新思路,为后期的相关临床研究提供重要信息.

【基金】 广西科技大学硕士研究生创新项目(GKYC201718);广西高校中青年教师基础能力提升项目(2017KY353);2017年度广西糖资源与加工重点实验室开放课题(2016TZYKF06,GXTZY201704)资助
  • 【DOI】10.16375/j.cnki.cn45-1395/t.2019.02.012
  • 【分类号】R737.9
  • 【下载频次】118
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