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1株3型鸭甲肝病毒的VP1和VP3基因的密码子使用偏性分析

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【作者】 殷茵闫艳新张灿任慧英刘文华

【Author】 YIN Yin;YAN Yanxin;ZHANG Can;REN Huiying;LIU Wenhua;College of Veterinary Medicine,Qingdao Agricultural University;

【通讯作者】 刘文华;

【机构】 青岛农业大学动物医学院

【摘要】 为了解临床分离的1株3型鸭甲肝病毒的结构蛋白VP1和VP3基因的密码子使用特性,本文对该毒株的VP1和VP3基因与从NCBI下载的同源性较高的3型鸭甲肝病毒进行了密码子偏性分析。结果表明,该毒株的VP1和VP3与所比对的5株3型鸭甲肝病毒VP1和VP3基因密码子使用模式基本一致,分别确定了12种和13种高频密码子,且偏爱以A或U结尾。通过6株3型鸭甲肝病毒的VP1和VP3基因的密码子偏性比较和聚类分析发现,其中4株分类地位相近。

【所属期刊栏目】 动物科学·动物医学 (2019年01期)
  • 【分类号】S852.65
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