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肠道病毒71型甘肃分离株VP1基因特征分析

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【作者】 李薇李建强赵祖波王智永赵英杰王玉琳

【Author】 LI Wei, LI Jian-qiang, ZHAO Zu-bo, WANG Zhi-yong, ZHAO Ying-jie, WANG Yu-lin (Lanzhou Institute of Biological Products, Lanzhou 730046, China)

【机构】 兰州生物制品研究所疫苗研究室兰州市疾病预防控制中心

【摘要】 目的分析肠道病毒71型(Enterovirus,EV71)甘肃分离株VP1基因的特征。方法应用RT-PCR法扩增4株EV71甘肃分离株(46F、47F、51F和55F)的VP1基因,克隆入pTA2载体,进行核苷酸序列测定,并进行序列的同源性比较及进化树分析。结果 4株病毒VP1核苷酸序列长度均为891bp,推导的氨基酸序列含297个氨基酸。51F与55F毒株核苷酸和氨基酸同源性均为100%,46F与47F的同源性分别为99.6%和99.0%,4株病毒与EV71的C4亚型毒株核苷酸同源性在96%以上,氨基酸同源性在99%以上。同源性和进化树分析显示,4株分离株分属2个群,其中51F和55F毒株同属一个群,其与昆明分离株kunming41-08亲缘关系最为相近;46F和47F同属一个群,其与内蒙分离株0723F/NM/CHN/07关系最为相近。结论 4株EV71甘肃分离株属于C4亚型,为中国EV71的基因分型、分子流行病学研究提供了参考。

【关键词】 肠道病毒71型VP1基因基因特征
【基金】 甘肃省科技重大专项计划课题(092GKDA010)
【所属期刊栏目】 基础研究 (2010年10期)
  • 【DOI】10.13200/j.cjb.2010.10.17.liw.020
  • 【分类号】R373
  • 【下载频次】77
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