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紫苏PfPDAT1基因序列及表达特性分析

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【作者】 周雅莉安茜任文燕李璐赵静王计平

【Author】 Zhou Yali;An Xi;Ren Wenyan;Li Lu;Zhao Jing;Wang Jiping;College of Agriculture,Shanxi Agricultural University;

【通讯作者】 王计平;

【机构】 山西农业大学农学院

【摘要】 [目的]发掘脂肪酸代谢关键酶基因,了解其编码蛋白的理化性质,探究该基因在紫苏不同组织中及不同逆境胁迫下的表达特性,为紫苏分子育种提供基因元件。[方法]利用生物信息学技术对转录组测序数据库中获得的紫苏PfPDAT1基因序列进行了分析,并采用qRT-PCR技术研究了不同逆境胁迫下该基因的表达特性。[结果]PfPDAT1基因cDNA全长序列为2 097 bp,包含1 554 bp的开放阅读框,编码517个氨基酸残基,通过预测将PfPDAT1基因编码蛋白定位于细胞质;多序列比对分析显示,PfPDAT1基因编码蛋白与芝麻和油橄榄具有较高的同源性,序列相似性分别为89%和83%;实时荧光定量PCR分析结果表明,PfPDAT1基因在‘晋苏1号’不同组织中均有表达,且在种子中表达量最高;PfPDAT1基因在NaCl、PEG6000和低温胁迫诱导时,其相对表达量有显著差异,且均在胁迫6 h时表达量达到最高。[结论]PfPDAT1基因在紫苏生长发育及抵御逆境胁迫过程中起重要作用。

【基金】 国家青年科学基金(31201266);山西省晋中市科技重点研发计划项目(Y172007-5)
【所属期刊栏目】 林学与园艺 (2018年12期)
  • 【DOI】10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201809002
  • 【分类号】S567.219
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】81
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