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番茄基因组研究进展

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【作者】 唐亚萍李宁王娟王柏柯杨生保郭斌杨涛郭春苗马凯刘君王欢余庆辉

【Author】 TANG Ya-ping;LI Ning;WANG Juan;WANG Bai-ke;YANG Sheng-bao;GUO Bin;YANG Tao;GUO Chun-miao;MA Kai;LIU Jun;WANG Huan;YU Qing-hui;Institute of Horticulture Crops, Xinjiang Academy of Agricultural Sciences;College of Computer and Information Engineering, Xinjiang Agricultural University;Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences;Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences;

【通讯作者】 王欢;余庆辉;

【机构】 新疆农业科学院园艺作物研究所新疆农业大学计算机与信息工程学院中国农业科学院作物科学研究所中国农业科学院生物技术研究所

【摘要】 【目的】综述国内外相关高质量番茄基因组研究进展,比较与分析第一、二、三代测序技术的研究成果,为番茄重要性状功能基因的挖掘及新品种选育提供参考。【方法】收集查阅国内外相关官网、文献资料和现有研究前沿技术,整理汇总并进行对比,分析番茄基因组测序技术研究进展。【结果】栽培番茄S.lycopersicum Heinz 1706基因组利用一代和二代测序技术8年完成测序和组装。3个野生番茄基因组采用二代测序技术3年完成,三代测序技术缩短了测序时间,并且在二代测序技术的基础上提高了基因组的质量,提供了完整性高达96.46%的野生番茄品种潘那利的参考基因组。【结论】测序技术推动了番茄基因组研究,三代测序技术与一、二代技术相比,在测序速度、基因序列读长和准确性方面显著提高,也使基因组组装更加精确。

【关键词】 番茄基因组测序技术功能基因
【基金】 农业部产业技术体系(CARS-23-G-25);新疆农科院重点项目前期预研专项(xjzdy-003);自治区创新人才建设专项-天山创新团队(2018D14005);国家重点研发专项(2017YFD0101906)~~
【所属期刊栏目】 作物遗传育种·种质资源·分子生物学 (2019年02期)
  • 【分类号】S641.2
  • 【下载频次】36
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