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丹参酮生物合成途径CYP450基因相关长链非编码RNA的筛选

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【作者】 蔡媛马莹郭娟王勇庆杜青陈同张水寒黄璐琦

【Author】 CAI Yuan;MA Ying;GUO Juan;WANG Yong-qing;DU Qing;CHEN Tong;ZHANG Shui-han;HUANG Lu-qi;Institute of Traditional Chinese Medicine,Hunan Academy of Traditional Chinese Medicine;State Key Laboratory Breeding Base of Dao-di Herbs,National Resource Center for Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences;

【通讯作者】 郭娟;张水寒;

【机构】 湖南省中医药研究院中药研究所中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地

【摘要】 丹参酮是中药丹参的主要有效成分,其生物合成途径表明细胞色素CYP450酶在丹参酮生物合成途径结构后修饰过程中发挥着重要作用。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的核苷酸,对药用植物的生长发育、次生代谢等具有重要调控作用。该研究通过对丹参毛状根进行诱导,利用高通量测序构建其长链非编码RNA文库,共获得8 942个差异lncRNA,其中6 755个基因间lncRNA,并鉴定出1 115 814个lncRNA-靶基因对,包括122个lncRNA-靶基因顺式对。对差异lncRNA与CYP450进行相关性分析,共鉴定出16 249个lncRNA-CYP450靶基因对。将其与丹参酮生物合成途径CYP76AH1,CYP76AH3,CYP76AK1基因进行靶向相关性分析,得到216个靶基因,这些候选基因为丹参酮生物合成途径下游调控机制研究奠定基础。

【关键词】 丹参丹参酮长链非编码RNACYP450
【基金】 国家自然科学基金青年基金项目(81503197,81573532.81822046);中央本级重大增减支项目(2060302);湖南省自然科学基金青年基金项目(2018JJ3310);湖南省中医药管理局项目(201810);湖湘中药资源保护与利用2011协同创新中心项目
【所属期刊栏目】 分子生药学 (2019年12期)
  • 【DOI】10.19540/j.cnki.cjcmm.20190324.101
  • 【分类号】S567.53
  • 【下载频次】164
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