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竹节参处理下嗜热四膜虫基因表达变化分析

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【作者】 柴小翠杨文涛汤琪马雪凤熊杰王平缪炜

【Author】 CHAI Xiao-cui;YANG Wen-tao;TANG Qi;MA Xue-feng;XIONG Jie;WANG Ping;MIAO Wei;Key Laboratory of Aquatic Biodiversity and Conservation,Institute of Hydrobiology,Chinese Academy of Sciences;University of Chinese Academy of Sciences;Institute of Geriatrics,Hubei University of Chinese Medicine;

【通讯作者】 王平;缪炜;

【机构】 中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室中国科学院大学湖北中医药大学老年医学研究所

【摘要】 竹节参是中国传统中药材,其活性成分对细胞损伤、衰老,细胞凋亡都有一定的药理活性。为了明确其药用机制和参与的代谢通路,该实验利用高通量转录组测序技术,对竹节参作用后嗜热四膜虫的基因表达情况进行了分析。基于转录组分析,对照组中共鉴定到3 544个差异表达基因,其中1 945个基因表达上调,1 599个基因表达下调,实验组共鉴定到3 312个差异表达基因,其中1 493个基因表达上调,1 819个基因表达下调。GO富集结果发现,对照组中细胞内一系列基本生命过程下调,如DNA复制、蛋白质合成,而细胞内信号转导过程和脂肪酸氧化过程加强;实验组中,下调基因主要富集在氧化还原、辅因子代谢和维生素代谢过程;上调基因参与了信号转导和蛋白修饰过程。利用KEGG数据库分析竹节参作用下的基因参与的通路发现,细胞自噬过程受抑制,而细胞周期过程加强。运用RT-qPCR技术检测了相关代谢通路中6个上调基因和4个下调基因的表达差异,并与转录组数据进行了相关性分析,二者结果一致。该研究为进一步探讨竹节参作用下细胞生长调控的药理机制提供了重要的方向和依据。

【基金】 老年病中药新产品湖北省协同创新中心项目
【所属期刊栏目】 药理 (2019年12期)
  • 【DOI】10.19540/j.cnki.cjcmm.20190304.001
  • 【分类号】R285.5
  • 【下载频次】42
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