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家猪基因组含有大量保守非编码区(英文)

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【作者】 钟兰李蔚李松岗

【Author】 ZHONG Lan 2,3) LI Wei 3,4) LI Songga ng 2,3,5) ( 2)College of Life Science, Peking University, Bei jing, 100871; 3)Beijing Geno mics Institute, Chinese Academy of Sciences, Beijing, 101300; 4)Laboratory of Bioinformatics, Institute of Biophysics, Chinese Ac ademy of Sciences, Beijing, 100101)

【机构】 北京大学生命科学院,中国科学院生物物理所生物信息研究室,北京大学生命科学院 北京,100871中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心,北京,101300,北京,100101,北京,100871中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心,北京,101300

【摘要】 用 190万条家猪随机读序分别比对人和小鼠的基因组 ,除去已知基因的外显子和新预测的人的编码区 ,得到大量含有保守非编码区的家猪序列。 11 0 5 %的家猪读序含有“猪 人”保守的非编码区序列 ,3 13%的家猪读序含有“猪 鼠”保守的非编码区片段 ,1 86 %的家猪读序包含“猪 人 鼠”三者保守的非编码区区域。三者保守的非编码区序列跟人的相似性明显高于跟小鼠的相似性。另外 ,很多人、小鼠的非编码RNA基因跟上述含有保守非编码片段的家猪序列至少比对上一次。

【基金】 “中国 丹麦”家猪基因组国际合作项目资助
  • 【DOI】10.13209/j.0479-8023.2003.121
  • 【分类号】S828
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】112
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