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细粒棘球绦虫DNA聚合酶δ小亚基EgPolD2基因的克隆及序列分析

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【作者】 吕国栋叶建蔚张传山王俊华李亮温浩林仁勇

【Author】 LV Guo-dong,YE Jian-wei,ZHANG Chuan-shan,WANG Jun-hua,LI Liang,WEN Hao,LIN Ren-yong(Base to Foster a State Key Lab for Major Disease Research in Xinjiang and Xinjiang Key Laboratory on Echinococcosis,First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University,Urumqi 830054,China)

【机构】 新疆医科大学第一附属医院新疆重大疾病医学重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地及新疆包虫病基础医学重点实验室

【摘要】 目的从新疆株细粒棘球绦虫原头蚴中克隆DNA聚合酶δ小亚基EgPolD2,进行序列测定和生物信息学分析。方法设计EgPolD2特异性引物,用RT-PCR方法从细粒棘球绦虫原头蚴cDNA中克隆EgPolD2基因,然后将其克隆至pMD18-T载体,测序并进行生物信息学分析,半定量反转录PCR分析其在细粒棘球绦虫原头蚴和囊泡中的表达情况。结果 EgPolD2基因开放阅读框为1 218bp,编码405个氨基酸,等电点为4.74。NCBI保守功能区分析软件预测EgPolD2蛋白第113~378个氨基酸为MPP_PolD2_C结构域。登陆GenBank进行Blast比对,EgPolD2与曼氏血吸虫SmPolD2基因同源性为32.1%,与线虫和人等其他物种PolD2基因同源性在18.3%~22.8%之间。进化树分析表明EgPolD2与SmPolD2相聚集,与其他物种同源性较低。半定量RT-PCR显示,EgPolD2在细粒棘球绦虫原头蚴和囊泡中均有表达,且表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。结论本实验成功克隆出细粒棘球绦虫EgPolD2新基因,为进一步研究抗细粒棘球绦虫药物靶标奠定了基础。

【关键词】 细粒棘球绦虫EgPolD2序列分析
【基金】 国家自然科学基金项目(No.81000746,30860253,30960341);新疆包虫病基础医学重点实验室开放课题资助项目(No.XJDX0202-2008-03)
【所属期刊栏目】 论著 (2012年07期)
  • 【DOI】10.13350/j.cjpb.2012.07.019
  • 【分类号】R440
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】56
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