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利用RNA-seq技术筛选大白猪皮下和肌内脂肪组织差异表达基因

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【作者】 黄万龙张秀秀李嫒苗向阳

【Author】 Wanlong Huang;Xiuxiu Zhang;Ai Li;Xiangyang Miao;Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences;

【机构】 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

【摘要】 为了比较分析大白猪皮下和肌内脂肪组织的全转录组数据,探究调控脂肪沉积的分子机制,本文采用RNA-seq技术和生物信息学方法鉴定大白猪皮下和肌内脂肪组织基因表达谱,对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)分析、信号通路富集分析以及蛋白互作网络分析。大白猪皮下和肌内脂肪组织中有180个基因差异表达,上调基因主要参与细胞增殖、脂质激酶活性和磷脂代谢等与脂质代谢相关的生物学过程正调控,下调基因显著富集于脂肪细胞分化中起重要调控作用的MAPK信号转导通路。差异表达基因主要通过参与脂质代谢及通过MAPK信号转导通路调控脂肪细胞成脂分化,进而影响大白猪皮下和肌内脂肪的沉积。

【基金】 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(编号:2013ywf-yb-5,2013ywf-zd-2);中国农业科学院农业科技创新项目(编号:ASTIP-IAS05);中国农业科学院创新基金项目(2004-院-1);国家高技术研究发展计划项目(“863”计划)(编号:2008AA10Z140);国家重点基础研究发展计划项目(“973”计划)(编号:2015CB943100)资助~~
【所属期刊栏目】 研究报告 (2017年06期)
  • 【DOI】10.16288/j.yczz.17-038
  • 【分类号】S828
  • 【被引频次】5
  • 【下载频次】341
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