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基于转录组数据对七叶树中三萜皂苷合成途径的研究

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【作者】 魏一丁熊超张天缘高翰尹青岗姚辉孙伟胡志刚陈士林

【Author】 WEI Yi-ding;XIONG Chao;ZHANG Tian-yuan;GAO Han;YIN Qing-gang;YAO Hui;SUN Wei;HU Zhi-gang;CHEN Shi-lin;School of Pharmacy,Hubei University of Chinese Medicine;Institute of Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences;Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College;

【通讯作者】 胡志刚;陈士林;

【机构】 湖北中医药大学药学院中国中医科学院中药研究所中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所

【摘要】 七叶树是七叶树科七叶树属高大乔木,集药用与观赏于一身。七叶树种子是其主要的药用部位,主要有效成分为齐墩果烷型三萜皂苷类化合物七叶皂苷。为了解七叶树三萜化合物生物合成的分子基础,该研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得七叶树种子与花的转录组数据,并对其代谢途径相关基因进行挖掘;使用Trinity软件实现unigene的de novo拼接;并将转录组的测序结果运用KEGG数据库进行注释,从而预测七叶树三萜代谢的具体途径。结果显示七叶树转录组共有2个三萜代谢途径相关数据集,分别为萜类物质前体代谢途径(途径编号为ko00900)和倍半萜与三萜代谢途径(途径编号为ko00909),对应的基因分别有47,27条。进一步根据催化酶与活性产物的总结比较分析发现萜类物质前体代谢途径相关酶共有8种,三萜代谢途径相关酶有3种。该研究首次在七叶树中解析出5条与三萜环化酶对应的基因,它们可能参与β-香树精合成进而形成七叶皂苷。通过种子与花的转录组表达差异分析显示,ko00900和ko00909途径相关的差异基因有33个;相对于花器官,种子中有17个unigenes表达量上调,16个unigenes表达量下调。该研究运用qRT-PCR实验对SQE(Unigene25806),HMGS(Unigene36710),β-AS(Unigene33291) 3个差异显著的关键酶基因的表达进行了试验验证,实验结果qRT-PCR结果与转录组数据一致。该研究所发现的七叶树的三萜皂苷合成相关候选基因能对七叶树三萜代谢合成与调控方面提供理论依据。

【关键词】 七叶树转录组β-香树精差异表达qRT-PCR三萜代谢
【基金】 国家中医药管理局项目(2015-21)
【所属期刊栏目】 分子生药学 (2019年06期)
  • 【DOI】10.19540/j.cnki.cjcmm.20190118.012
  • 【分类号】R284
  • 【下载频次】185
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