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少根紫萍转录因子及其营养胁迫下的表达

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【作者】 李志丹方扬靳艳玲丁彦强何开泽李燕王琼瑶赵海

【Author】 LI Zhidan;FANG Yang;JIN Yanling;DING Yanqiang;HE Kaize;LI Yan;WANG Qiongyao;ZHAO Hai;Key Laboratory of Environment and Applied Microbiology, Chinese Academy of Sciences;Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences;University of Chinese Academy of Sciences;Sichuan Provincial Academy of Natural Resource Sciences;

【机构】 中国科学院环境与应用微生物重点实验室中国科学院成都生物研究所中国科学院大学四川省自然资源科学研究院

【摘要】 少根紫萍(Landoltia punctata)是一种浮水生、多功能、高环境适应能力的能源植物,为了解其生理特性的分子机制,利用少根紫萍转录因子预测数据与拟南芥、水稻、玉米数据库数据进行宏观比较,并结合转录组测序技术对少根紫萍营养胁迫后转录因子表达分析.结果显示,少根紫萍有1 076个转录因子,分属于66个家族,其中在b ZIP、WRKY、AP2/ERFERF、MYB、NAC、MADS-box等家族基因数明显减少,一定程度上解释了浮萍高黄铜低木质素、难开花的生理特性;少根紫萍在营养胁迫下偏向上调AP2/ERF-ERF、MYB、bHLH家族特定基因和下调AP2/ERF-ERF、WRKY家族特定基因来响应营养胁迫,尤其是AP2/ERF-ERF、WRKY两个家族中特定基因表达下调在响应水体营养胁迫中有非常重要的作用.本研究在转录因子层面对浮萍的生理特性,特别针对营养胁迫下转录因子的表达进行了探究,可为建立浮萍水生模式植物系统、深入探讨少根紫萍响应营养胁迫机制以及改造成耐受胁迫的高效淀粉积累能源植物提供理论指导.

【关键词】 少根紫萍转录因子营养胁迫转录组
【基金】 国家科技支撑计划项目(2015BAD15B01);科技部国际合作计划项目(2014DFA30680);中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目(KFJEW-STS-121);中国科学院专项研究基金计划项目(KLEAMCAS201501);中国科学院开放研究基金计划项目(KLCAS-2014-02)资助;四川省科技支撑计划项目(2016SZ0070);德阳中科先进制造创新育成专项资金项目(YC-2015-QC01)~~
【所属期刊栏目】 研究论文 (2018年01期)
  • 【DOI】10.19675/j.cnki.1006-687x.2017.04015
  • 【分类号】Q943.2;S578
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