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高通量测序研究松茸菌柄土壤细菌群落结构

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【作者】 叶雷付雨李强王强峰张波邹捷亢宗静张笑萍李小林

【Author】 YE Lei;FU Yu;LI Qiang;WANG Qiangfeng;ZHANG Bo;ZOU Jie;KANG Zongjing;ZHANG Xiaoping;LI Xiaolin;Soil and Fertilizer Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences;College of Resource,Sichuan Agricultural University;Key Laboratory of Bioresources and Ecoenvironment of Ministry of Education,College of Life Sciences,Sichuan University;Biotechnology and Nuclear Technology Research Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences;

【机构】 四川省农业科学院土壤肥料研究所四川农业大学资源学院四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川省农业科学院生物技术核技术研究所

【摘要】 为了解松茸-菌柄根际微生物互作关系,采用Illumina Hiseq 2500平台高通量测序方法,研究松茸菌柄附着土壤的细菌群落结构,分析微生物因素对松茸的形成和生长的影响.通过高通量测序共获得了6 730条质控序列,这些序列按照97%的相似度被分为928个操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs),这些OTUs又被分为22个细菌门、2个古细菌门、62个细菌纲、4个古细菌纲、90个细菌目、6个古细菌目、162个细菌科、7个古细菌科、275个细菌属、8个古细菌属.在门的水平,变形菌门(Proteobacteria)在所有样品中均占主导,且在松茸菌柄土壤样品中高于对照样品;从纲的水平来看,β-变形菌门(Beta-proteobacteria)占主导,且在松茸菌柄土壤样品中高于对照样品;从属的水平看,伯克氏菌属(Burkholderia)隶属于变形菌门,在松茸土壤样品中的丰度显著高于对照,表明变形菌门对松茸的生长可能具有积极贡献,尤其是伯克氏菌属.此外,一些菌可能对松茸的生长具有消极贡献,如Unknown-Ellin 60等.本研究表明,细菌可能参与了松茸的生长和子实体的形成,但与细菌的丰富度不成正相关,这对松茸的人工种植将具有重要理论指导意义.

【基金】 四川食用菌创新团队资助~~
【所属期刊栏目】 研究论文 (2018年03期)
  • 【DOI】10.19675/j.cnki.1006-687x.2017.08006
  • 【分类号】S154.3
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