网络首发时间:2018-05-02 14:12:27

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基于BSA分析定位控制西藏大麦侧小穗发育的基因

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【作者】 徐珍媚邓光兵张海莉梁俊俊龙海余懋群

【机构】 中国科学院成都生物研究所中国科学院大学

【摘要】 大麦侧小穗结实与否产生了二棱/六棱性状,从而显著影响其籽粒产量,因此大麦二棱到六棱的变化具有显著驯化特征。青藏高原野生和栽培大麦资源丰富,被认为是栽培大麦的驯化和遗传多样性中心之一。为了进一步了解大麦棱数调控的遗传基础以及西藏栽培大麦驯化的过程,我们以西藏野生二棱大麦和六棱大麦地方品种为亲本构建遗传分离群体,遗传分析发现二棱性状受单个显性基因位点控制。通过集群分离(BSA,Bulked segregant analysis)法分别建立含有22个F2单株的二棱混池和六棱混池,基于SLAF-seq(Specific-locus amplified fragment sequencing)技术共获得456 691个SLAF标签,通过SNP-index和ED两种关联算法交集得到3个与棱数性状相关的侯选区域,总长度为53.84 Mb,包含536个基因,其中能分别被GO、KEGG和COG三个数据库注释的基因有413、189和160个基因。上述研究结果实现了对控制西藏大麦侧小穗发育性状相关基因的初步定位,可为后续目标基因的精细定位和克隆提供理论参考。

【基金】 国家自然科学基金面上项目(31771790);四川省科技支撑计划-四川省农作物分子育种平台项目(2016NZ0103);四川省育种公关项目(2016NYZ0030)
  • 【DOI】10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.03032
  • 【分类号】S512.3
  • 【下载频次】30

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