网络首发时间:2018-10-23 13:17:48

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通过宏基因组学发现生物催化剂

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【作者】 彭司华孙丹袁文亮卫偲

【机构】 上海海洋大学水产与生命学院发育生物学系水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学)农业部国家水生动物病原库(上海洋大学)科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学)上海理工大学光电信息与计算机工程学院

【摘要】 现在大多数化学合成使用对环境有害的有机溶剂。如果用酶作为生物催化剂,则可在化学合成反应中少使用或不使用有机溶剂,所以使用酶作为催化剂更环保。随着宏基因组学的发展,以及二代测序成本的持续大幅度下降,基于宏基因组学获得生物催化剂已经成为最重要的方法。本文综述了基于宏基因组学发现生物催化剂的各种方法,对目前世界上采用的各种筛选方法进行了归纳,共总结出两大类方法。一是基于宏基因组文库的筛选方法,另一种是基于序列的遗传筛选方法。进一步对这两类方法细分为具体的7种筛选方法,并对各种方法的优缺点逐一进行了回顾和评述。同时,对各种基于宏基因组学筛选生物催化剂的方法得到的结果进行了统计分析,指出表型选择法筛选是采用最多的方法,有很大的实用价值。本文认为直接二代测序进行生物信息学筛选的方法也是有潜力的一种筛选方法。最后,对基于宏基因组学筛选生物催化剂的未来发展进行了展望,认为三代测序技术将在基于宏基因组学的生物催化剂筛选中发挥重要作用。

【基金】 上海市自然科学基金项目(15ZR1420800);上海海洋大学博士科研启动项目(A2-0203-00-100313)资助
  • 【DOI】10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.05003
  • 【分类号】Q78
  • 【下载频次】109

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