野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析

【作者】 马燕明； 陈春海； 杨凯； 李奕松； 赵波； 李江； 李永强； 万平；

【机构】 北京农学院/北京农业应用新技术北京市重点实验室； 深圳华大基因；

【摘要】 micro RNA(mi RNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用,mi RNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度mi RNA测序。系统鉴定和注释这两个物种的mi RNA,并分析了两物种之间mi RNA种类的异同、表达量的差异和靶基因在功能富集上的差别。鉴定出了JN6和CWA108共有和特有的mi RNA,明确了它们之间差异表达的mi RNA,以及这些特有和差异mi RNA的靶基因在功能富集上的差异,发现可能和抗病与抗逆途径相关。更多还原