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日本百脉根■牛儿基■牛儿基氢化酶的电子克隆及进化分析

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【作者】 李晓晓李蕊李雅轩蔡民华胡英考

【Author】 Li Xiao-xiao et al(College of Life Science,Capital Normal University,Beijing 100037)

【机构】 首都师范大学生命科学学院首都师范大学生命科学学院 北京100037北京100037

【摘要】 根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以拟南芥牛儿基牛儿基氢化酶(GGH)基因cDNA序列为信息探针,搜索GenBank中的HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的日本百脉根基因组DNA序列LJT46M09,用GENSCAN软件分析该序列得到一个包含2个外显子和1个内含子的基因。以此基因序列BLAST检索GenBank中的est-others数据库获得了同源的EST片段。进行EST拼接后得到该基因的cDNA序列,GenBank登录号为DQ013361,由1 389 bp核苷酸组成,具有完整的开放阅读框架(ORF),推测编码蛋白为462个氨基酸。推导的氨基酸序列与大豆、截形苜蓿、烟草、拟南芥、小麦、水稻的牛儿基牛儿基氢化酶基因氨基酸序列的一致率分别为91%、89%、84%、81%7、3%、74%。该基因与叶绿素等的生物合成有关。

【基金】 北京市教委科技发展计划项目基金(200310028112)资助
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2006.23.033
  • 【分类号】Q943.2;Q941
  • 【下载频次】537
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