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真核生物启动子TATA-box·GC-box和CAAT-box的分析

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【作者】 张小辉祁艳霞

【Author】 ZHANG Xiao-hui et al (College of Animal Science and Technology,Henan University of Science and Technology,Luoyang,Henan 471003)

【机构】 河南科技大学动物科技学院河南科技大学动物科技学院 河南洛阳471003河南洛阳471003

【摘要】 下载了已经通过试验证实的2 541条真核生物启动子序列,运用生物信息学方法分析了TATA-box、GC-box和CAAT-box的数量及其在启动子中的分布情况。结果表明,有23.85%真核生物启动子序列中至少有1个TATA-box,且TATA-box主要分布在转录起始位点前24~36 bp的区域内;有47.30%真核生物启动子序列中至少有1个GC-box,且GC-box在转录起始位点前23~128 bp的区域内分布比较集中;有42.35%真核生物启动子序列中至少有1个CAAT-box,且CAAT-box在转录起始位点前51~159 bp的区域内分布比较集中。这说明TATA-box在真核生物启动子中的位置比较固定,对基因转录的正确起始可能起着重要的作用;而GC-box和CAAT-box分布区域较广,数量也明显多于TATA-box。

【关键词】 真核生物启动子TATA-boxGC-boxCAAT-box
【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2008年04期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.04.008
  • 【分类号】Q75
  • 【被引频次】64
  • 【下载频次】1760
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