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油桐种子FADX基因的克隆和序列分析

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【作者】 李元汪阳东李鹏魏建民

【Author】 LI Yuan et al(Collegeg of Bioengineering,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot,Inner Mongolia 010018)

【机构】 内蒙古农业大学生物工程学院中国林业科学研究院亚热带林业研究所内蒙古农业大学生物工程学院 内蒙古呼和浩特010018浙江富阳311400内蒙古呼和浩特010018

【摘要】 [目的]克隆油桐种子FADX基因全长cDNA。对该基因作生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能提供参考。[方法]以未成熟的油桐种子为材料,利用改良TRIzoL法提取总RNA,并根据GenBank中已经登录的α桐酸合成酶基因FADX的序列,设计特异性引物;采用RTPCR方法,克隆得到FADX基因全长cDNA,应用Antheprot软件和InterProScan对该基因进行了生物信息学分析。[结果]该序列5’端和3’端非编码区序列长度分别为13、47 bp,含有1个开放阅读框(14~1 174 bp),编码386个氨基酸,含有典型的脂肪酸脱氢酶结构域;相对分子量是44 343.0,理论等电点为8.33。二级结构预测表明,该蛋白α螺旋含量占29%,β折叠占32%,转角占6%。[结论]该蛋白属于脂肪酸脱氢酶。

【关键词】 油桐FADX基因克隆生物信息学分析
【基金】 浙江省重大科技项目“能源植物种质资源与高能植物品种选育及中试”(2006#2009)(2005C12003);中国林科院科技发展基金项目“生物柴油原料植物油桐脂肪酸合成酶相关基因克隆和功能分析”(2006-2007)
  • 【分类号】S794.3
  • 【被引频次】21
  • 【下载频次】170
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