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猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株非编码区及结构蛋白的生物信息学分析

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【作者】 宋振辉张鹦俊

【Author】 SONG Zhen-hui et al (Department of Animal Medicine,Southwest University(Rongchang School District),Chongqing 402460)

【机构】 西南大学荣昌校区动物医学系西南大学荣昌校区图书馆

【摘要】 利用生物软件对猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株非编码区及结构蛋白所含的生物学信息进行了分析。结果显示,SC-Y株与TGEV其他参考毒株(Miller M60、Miller M6、Purdue、Purdue P115、PUR46-MAD、TS)5′UTR的二级结构差异显著,预测结构蛋白特性显示,N蛋白没有跨膜区域、糖基化位点及信号肽序列,属于非分泌性蛋白。在4种结构蛋白中,N蛋白的氨基酸变异率最低,为2.14‰。与MillerM60株、Miller M6株和TS株相比,SC-Y株S基因第1 123~1 128位核苷酸缺失6个碱基(AATGAT),在sM基因核苷酸第163~165位,SC-Y株比TFI株和FS772/70株多出3个碱基(ATT)。

【所属期刊栏目】 动物科学 (2008年22期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.22.129
  • 【分类号】S852.65
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】128
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