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四川白鹅白细胞介素-2基因的克隆及生物信息学分析

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【作者】 丁轲程安春汪铭书朱德康陈孝跃

【Author】 DING Ke et al(Research Center of Avian Disease,College of Animal Science and Veterinary Medicine of Sichuan Agricultural University,Ya’an,Sichuan 625014)

【机构】 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心

【摘要】 [目的]克隆分析四川白鹅白细胞介素-2(IL-2)基因。[方法]参照GenBank中发表的鸭IL-2基因保守序列,设计1对引物,采用RT-PCR技术从ConA刺激的四川白鹅外周血淋巴细胞的总RNA中扩增鹅IL-2基因,并进行测序及生物信息学分析。[结果]四川白鹅IL-2基因全长468 bp,含1个441 bp的开放阅读框(ORF),编码146个氨基酸。生物学软件分析表明该序列编码的氨基酸序列中有4个磷酸化位点,1个糖基化位点,含有21个氨基酸残基组成的信号肽。同源性分析表明四川白鹅IL-2基因与鸭、鸡和火鸡IL-2核苷酸及氨基酸序列同源性均分别为92.2%、77.5%、78.2%和85.8%、65.5%、64.1%,而与其他种属的哺乳动物及啮齿类动物(如人、猴、大鼠、牛、马、猪、猫、小鼠、兔和鹿)的IL-2基因的核苷酸和氨基酸同源性均分别低于45%和28%。[结论]四川白鹅IL-2基因与鸭和鸡具有较近的亲缘关系。

【关键词】 四川白鹅白细胞介素-克隆遗传进化
【基金】 教育部“新世纪优秀人才支持计划”项目(NCET-04-0906);四川省重大基础研究项目(03JY029-035-1/04JY029-006-1);四川省重点建设学科项目(SZD0418)
【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2008年27期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.27.115
  • 【分类号】S835
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】74
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