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不同物种ATGL基因部分序列的生物信息学分析

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【作者】 杨红文粟朝芝王春凤韦毕芬

【Author】 YANG Hong-wen et al(Guizhou Institue of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Guiyang,Guizhou 550005)

【机构】 贵州省畜牧兽医研究所

【摘要】 [目的]深入了解ATGL基因的遗传多样性以及不同物种ATGL基因间的分子系统进化关系。[方法]应用比较基因组学和生物信息学方法分析了8个物种ATGL基因的遗传多样性和分子系统进化。[结果]32条基因序列共检测到77个多态位点,发现12种单倍型。各物种间核苷酸歧异度和净遗传距离分别在0.005 48~0.197 37和0.004 39~0.197 37。分子系统进化树结果显示,人、猕猴、黑猩猩之间以及挪威鼠和家鼠之间的亲缘关系较近,而狗、牛与家鼠间的亲缘关系较远。人、家鼠和猪的非同义替换位点数明显高于同义替换位点数。各同源ATGL基因的有效密码子数和密码子偏爱指数分别在27.618~38.016和0.643~0.807。[结论]该结果为进一步研究AT-GL基因的生物学功能和确定动物脂肪沉积及肉质性状的候选分子标记提供了基础资料。

【基金】 贵州省农业科学院重点项目[黔农科院(人才)07001]
【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2008年29期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.29.135
  • 【分类号】S813
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】193
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