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数字差异显示法在猪早期胚胎基因表达分析上的应用

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【作者】 杨小淦卢晟盛刘红波任子利吕培茹张明陆阳清卢克焕

【Author】 YANG Xiao-gan et al (Guangxi Key Laboratory of Subtropical Bio-resource Conservation and Utilization,Guangxi University,Nanning,Guangxi 530004)

【机构】 广西大学,广西亚热带生物资源保护利用重点实验室

【摘要】 借助于NIH生物信息中心Unigene里的数字差异显示软件平台,分析了猪植入前后早期胚胎发育9个EST文库的105 227个ESTs,筛选出了104个差异表达ESTs,对已知功能的差异表达基因进行GO分类分析,发现这些差异基因参与了广泛的生物功能和过程。同时,这些差异表达ESTs的聚类分析结果显示,体外和体内发育的囊胚基因表达存在较大的差异。对这些差异表达ESTs表达模式的分析结果显示,猪植入前早期胚胎发育阶段基因呈振荡模式表达,其中线粒体和核糖体相关基因的表达在囊胚中的表达丰度要明显高于其他阶段。表达数字差异显示的结果能为猪早期胚胎发育机理的研究提供线索。

【关键词】 早期胚胎数字差异显示
【基金】 国家自然基金资助项目(30660127)
【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2008年31期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2008.31.143
  • 【分类号】S828
  • 【下载频次】93
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