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河豚4SNc-Tudor蛋白的鉴定及生物信息分析

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【作者】 徐庆刚陆健郑建洲陈华友陈克平

【Author】 XU Qing-gang et al(Institute of Life Science,Jiangsu University,Zhenjiang,Jiangsu 212013)

【机构】 江苏大学生命科学研究院

【摘要】 [目的]对河豚4SNc-Tudor蛋白(SN4TDR)进行序列与结构相关的生物信息分析,为认识该蛋白结构与功能提供借鉴。[方法]应用双向电泳及基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱(MALD I-TOFMS)技术,从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc-Tudor结构域蛋白。并对其进行生物信息学分析。[结果]首次从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc-Tudor结构域蛋白SN4TDR。河豚SN4TDR定位于细胞质,无信号肽,为非分泌蛋白,有多个磷酸化位点。蛋白SN4TDR存在α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构,有一个可能形成跨膜结构的片段。并用同源建模的方法,预测了河豚SN4TDR的三维结构模型。[结论]分析河豚SN4TDR基因及蛋白结构,有助于进一步研究该蛋白及其基因的分子和生物学功能。

【关键词】 河豚MALDI-TOFMS4SNc-Tudor生物信息学
【基金】 江苏省高校自然科学基金项目(08KJD180008)
【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2010年03期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2010.03.148
  • 【分类号】S917.4
  • 【被引频次】8
  • 【下载频次】162
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