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猪繁殖与呼吸综合症流行株ORF5基因遗传变异分析

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【作者】 尹国友孙婕陈兰英赵祯

【Author】 YIN Guo-you et al (Biological Engineering Department,Henan University of Urban Construction,Pingdingshan,Henan 467044)

【机构】 河南城建学院生物工程系

【摘要】 [目的]分析猪繁殖与呼吸综合症发病原因,流行趋势,为预防和控制猪繁殖与呼吸综合症病毒(PRRSV)提供理论依据。[方法]根据GenBank上的PRRSV的ATCCVR-2332的全基因序列,设计并合成引物,采用RT-PCR技术扩增了7株流行株中的ORF5基因序列。应用DNAStar软件分析所测序列,并与ATCCVR-2332、CH-1a、BJ-4、LV及疫苗株MLV进行序列比较。同时用系统进化树分析了分离株之间的系统进化树。[结果]核苷酸序列分析表明这7株流行株中ORF5基因与VR-2332、CH-1a、BJ-4等代表株的同源性分别为88.1%~98.8%,89.9%~95.2%,85.6%~98.7%;与LV的同源性为54.7%~56.9%。氨基酸序列分析表明,这7株流行株与VR-2332、CH-1a、BJ-4等代表株的同源性分别为88.1%~96.8%,88.1%~94.5%,86.1%~96.5%;与LV的同源性为54.7%~56.2%。[结论]流行株在ORF5基因区域的变异较大,同一地域分离株间ORF5基因序列同源性较高且亲缘关系较近,不同地域则较远。

【所属期刊栏目】 动物与饲料科学 (2010年08期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2010.08.131
  • 【分类号】S858.28
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】70
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