节点文献

棉花乙烯受体基因的电子克隆及生物信息学分析

免费订阅

【作者】 潘玉欣穆晓阳

【Author】 PAN Yu-xin et al(Hebei Polytechnic University,Tangshan,Hebei 063009)

【机构】 河北理工大学

【摘要】 [目的]电子克隆并分析棉花乙烯受体基因(Ethylene Receptor,ETR)。[方法]利用生物信息学方法,以毛果杨的ETR基因家族序列为基础,电子克隆棉花乙烯受体基因开放阅读框,并对序列进行氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、信号肽及系统进化等预测分析。[结果]通过电子拼接,共获得该基因家族的2个棉花ETR基因GhETR1和GhETR2。2个基因开放阅读框长度分别为2 289 bp和2 226 bp,编码含762和741个氨基酸残基的肽链。经生物信息学分析发现,两基因分属于ETR2和ETR1亚家族。N端有典型的跨膜区,含有ETR蛋白的保守域GAF、H isKA、HATPase-c和REC。GhETR1与毛果杨XP002315717、XP002311669相似性较高,GhETR2与毛果杨XP002299688、XP002327419相似性较高。[结论]该研究结果为进一步研究棉花GhETR基因在棉纤维发育中的作用奠定了基础。

【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2010年16期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2010.16.091
  • 【分类号】S562
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】189
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: