节点文献

用最短路径传递共表达预测拟南芥基因功能

免费订阅

【作者】 史锋莉黄继风

【Author】 SHI Feng-li et al (College of Information,Mechanical and Electrical Engineering,Shanghai Normal University,Shanghai 200234)

【机构】 上海师范大学信息与机电工程学院

【摘要】 提出基因之间传递共表达可作为一个重要因素来连接同一代谢通路中的基因,而同一代谢通路中的功能相似的基因都是高表达相关的。因此可通过求代谢通路下的最短路径,由同在一条最短路径上的与未知基因高表达相关的已知基因来预测未知基因的功能。通过用最短路径算法分析拟南芥代谢通路下的共表达数据对未知基因的功能进行预测,证明了此方法可以预测出拟南芥代谢通路下未知基因的功能,并验证了通过在代谢通路下求最短路径来预测基因功能的方法具有一定的可行性和有效性。

【关键词】 最短路径代谢通路共表达基因功能拟南芥
【基金】 上海市教育委员会教育科学研究项目(07ZZ60)
【所属期刊栏目】 农业基础科学与方法 (2010年23期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2010.23.099
  • 【分类号】Q943.2
  • 【下载频次】99
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: