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不同来源的5株新城疫病毒的分离·鉴定与基因型分析

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【作者】 黄银云

【Author】 HUANG Yin-yun(Jiangsu Animal Husbandry and Veterinary Professional College,Taizhou,Jiangsu 225300)

【机构】 江苏畜牧兽医职业技术学院

【摘要】 [目的]分离鉴定不同来源的5株新城疫病毒(NDV),并对其基因型进行分析。[方法]从江苏和广西发病孔雀、鸡、鹅群分离到5株NDV。参照文献合成1对引物P1和P2,用于扩增基质蛋白基因(M)1161nt至融合蛋白基因(F)889nt之间长约970nt的片段。用TrizolRNA试剂盒抽提5株NDV基因组,再按照Promega说明书,用上游引物P1合成F基因cDNA,合成的cDNA作为聚合酶链式反应(PCR)的扩增模板,用PCR反应扩增F基因目的片段。将所得产物进行序列测定,获得这5株NDVF基因5′端约890nt序列。采用DNAMAN软件对F基因47~420nt间的片段进行序列分析,并推导出相应的氨基酸序列。在此基础上,从GenBank中选取32个参考毒株与这5个分离株进行遗传变异分析,并绘制系统发育进化树。[结果]同源性分析比较表明,5株NDV分离株之间的差异性很小,它们之间的同源性为95.00%~97.00%,其中2株广西分离株之间的同源性为97.07%,3株鹅源分离株之间的同源性为96.43%。所有毒株F蛋白裂解区氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,符合强毒株裂解区位点特征。这5株NDV分离株均属于基因Ⅶ型和Ⅶd亚型。[结论]近几年流行的NDV的主导基因型为基因Ⅶ型,且来自不同宿主的毒株之间的差异性较小。

【关键词】 新城疫病毒分离鉴定基因Ⅶ型
【所属期刊栏目】 动物科学 (2010年29期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2010.29.145
  • 【分类号】S852.65
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