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适用变性梯度凝胶电泳分析的石油污染土壤微生物DNA模板制备的研究

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【作者】 韦超英杨滨银方新湘娄恺晁群芳

【Author】 WEI Chao-ying et al (College of Life Science and Technology,Xinjiang University,Urumqi,Xinjiang 830046)

【机构】 新疆大学生命科学与技术学院中国石油克拉玛依石化分公司炼油化工研究院新疆特殊环境微生物实验室

【摘要】 [目的]为了快速、简便和经济地获得理化性质不同的石油污染土壤中微生物总DNA,以用于后续微生物群落结构分析及动态监测。[方法]采用3种提取方法对石油污染土壤中细菌总DNA进行提取,并通过DNA产量、纯度、片段大小、基因组完整性等对提取得到的DNA质量进行评价;并对16S rDNAV3可变区的PCR扩增产物进行DGGE分析。[结果]采用3种方法均能从石油污染土壤中提取得到相应的细菌DNA片段,且针对同一种提取方法,土壤理化性质的差异对DNA提取效果影响不明显,但不同方法提取得到的DNA在浓度和纯度上存在明显差异。采用3种方法提取得到的DNA量分别可达98.3、79.9和43.8 ng/μl。[结论]选取方法1提取基因组DNA并进一步纯化,纯化后的DNA分别采用引物F27/R1492和F357/R518进行16S rDNA及116S rDNAV3可变区的扩增,获得了条带清晰、浓度高、无污染的DNA目的片段;对其PCR扩增产物进行DGGE分析,得到的DGGE图谱可直观反应石油污染土壤中微生物的多样性及优势种群。

【关键词】 DNA提取石油污染土壤DGGE
【基金】 国家自然科学基金项目(30960089)
【所属期刊栏目】 农业生物技术 (2011年16期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2011.16.060
  • 【分类号】X53
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】306
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