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巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的克隆和分析

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【作者】 尚常花朱顺妮袁振宏王忠铭

【Author】 SHANG Chang-hua et al(Guangzhou Institute of Energy Conversion,Chinese Academy of Sciences;Key Laboratory of Renewable Energy and Natural Gas Hydrate,Chinese Academy of Sciences,Guangzhou,Guangdong 510640)

【机构】 中国科学院广州能源研究所中国科学院可再生能源与天然气水合物重点实验室

【摘要】 [目的]获得巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[方法]以巴夫杜氏藻cDNA为模板,采用简并引物进行PCR扩增,获得533bp特异cDNA片段。在此基础上,设计特异引物,采用5’-Genome Walking和3’-RACE的方法,获得基因的5’-端DNA序列和3’-端cDNA序列,进而获得β-肌动蛋白基因cDNA全长序列。[结果]获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因的特异cDNA片段、5’-端DNA和3’-端cDNA片段。经拼接后,扩增出全长cDNA。β-肌动蛋白基因cDNA全长1754bp,包括1137bp的开放读码框和617bp的3’-非翻译区序列。氨基酸序列相似性分析发现,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白氨基酸序列与杜氏盐藻、莱茵衣藻等的同源性较高。系统发育分析表明,巴夫杜氏藻β-肌动蛋白与杜氏盐藻的相似性最高。[结论]首次获得了巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因cDNA全长序列,并发现巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因非常保守。

【关键词】 巴夫杜氏藻β-肌动蛋白基因克隆
【基金】 广东省中国科学院全面战略合作项目(No.2010A090100010);科技部十二五支撑计划(No.2011BAD14B03);中国科学院可再生能源与天然气水合物重点实验室基金(No.y107j6)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2011年28期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2011.28.006
  • 【分类号】Q943.2
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】63
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