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东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及多样性分析

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【作者】 邓晓娟罗向东谢建坤万勇胡标林曹娟芳戴亮芳

【Author】 DENG Xiao-juan et al (College of Life Science,Jiangxi Normal University,Nanchang,Jiangxi 330022)

【机构】 江西师范大学生命科学学院江西省农业科学水稻研究所江西省水稻生理及遗传重点实验室

【摘要】 [目的]研究东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及对其进行多样性分析。[方法]以东乡野生稻(O.rufipogon Griff.,供体)和栽培稻协青早B(O.sativa sp.indica Kato.,受体)构建的BC1F6渐渗群体为研究材料,利用筛选出的分布在12对染色体上的25对SSR引物对群体中的239个株系进行多态性分析。[结果]25个微卫星位点都有东乡野生稻DNA片段不同程度的渗入,群体均大部分保留亲本协青早B或东乡野生稻的DNA序列。渐渗系基因组中平均受体纯合条带百分率为78.13%,最高达94.98%(引物为RM131),最低为60.25%(引物为RM171)。平均供体纯合条带百分率为13.37%,最高达32.64%(引物为RM171),最低为2.93%(RM1095)。群体中还存在一些杂合位点,平均杂合率为5.62%,最高达10.04%(引物为RM401)。此外,BC1F6渐渗群体中发现有双亲条带的丢失和一些双亲所没有的新条带出现,其中平均亲本条带丢失率为2.88%,最高达13.39%(引物为RM311),最低为0(引物为RM401),平均新带率为1%。高世代渐渗群体平均Nei’s基因多样性(He)和平均Shannon’s信息多样性指数(I)分别为0.276和0.457。[结论]通过远缘杂交,渐渗系发生了广泛遗传与表观遗传变异,扩大了遗传变异基础,为水稻品种改良与种质创新奠定了重要基础。

【基金】 国家自然基金项目(30860120、30900781);江西省教育厅科技计划项目(GJJ09464);江西省自然基金(2008GQN0059)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2012年03期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.03.176
  • 【分类号】S511.9
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】152
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