节点文献

应用生物信息学分析大米过敏原RAG1的B细胞表位

免费订阅

【作者】 李燕芳何颖邹泽红

【Author】 LI Yan-fang et al(Guangzhou Municipal Key Laboratory of Allergy & Clinical Immunology,Allergy Research Branch of the State Key Laboratory Respiratory Disease,the Second Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University,Guangzhou,Guangdong 510260)

【机构】 广州医学院第二附属医院/呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室/广州市过敏反应与临床免疫重点实验室

【摘要】 [目的]预测大米主要过敏原RAG1的二级结构及B细胞表位。[方法]从Expasy蛋白质数据库中获得编码大米过敏原RAG1的氨基酸序列并以此氨基酸序列为基础,通过DNAStar Protean软件,采用Gamier-Robson方案、Chou-Fasman方案和Karplus-Schulz方案预测RAG1的二级结构,用Kyte-Doolittle亲水性方案、Emini表面可及性方案J、ameson-Wolf抗原性指数方案综合预测RAG1的B细胞表位。[结果]对大米过敏原RAG1的二级结构和B细胞表位预测的结果表明,第33~441、19~129、155~163区段可能是B细胞的优势表位。[结论]该研究综合应用多方法多参数预测大米过敏原RAG1潜在的B细胞优势表位,为RAG1 B细胞表位的进一步鉴定及其抗原性改造、表位疫苗设计等研究提供了理论依据。

【关键词】 大米过敏原RAG1二级结构B细胞表位
【基金】 国家自然科学基金项目(30771240);广州市教育系统科研创新学术团队(B94118)课题
【所属期刊栏目】 生物技术 (2012年06期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.06.081
  • 【分类号】R392.1;S511
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】76
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

浏览历史:
下载历史: