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Sus scrofa interferon epsilon-1基因的克隆与序列分析

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【作者】 杜会坡台玉磊王伟杰杨国宇

【Author】 DU Hui-po et al(Yichuan County Animal Diseases Control Center,Luoyang,Henan 471300)

【机构】 伊川县动物疫病预防控制中心河南农业大学动物生理生化实验室洛阳市动物疫病预防控制中心

【摘要】 [目的]克隆分析Sus scrofa interferon epsilon-1基因,以期为其生物学功能研究奠定基础。[方法]利用Homo sapiens interferon epsi-lon 1(IFNE1)序列(NM176891.3)对猪HTG库进行搜索,通过对获得的2个片断(CU074336、AC127471)的序列分析,在5’-UTR和3’-UTR设计1对克隆引物,对7日龄仔猪的胃组织进行RT-PCR,将PCR产物克隆、测序,并进行相关分析。[结果]同源性分析结果表明,猪SIFNE1与人、小鼠interferon epsilon-1基因cDNA编码区(CDS)的同源性分别为83.6%和69.2%;蛋白序列同源性分别为76.2%和55.2%。推测其氨基酸序列信号肽为第1~21位氨基酸,IFabd结构域为第59~176位氨基酸,结构特征与人、小鼠的interferon epsi-lon-1相一致。[结论]该研究克隆了Sus scrofa interferon epsilon-1基因,为进一步研究SIFNE1基因的生物学功能奠定了基础。

【关键词】 SIFNE1克隆序列分析
【所属期刊栏目】 生物技术 (2012年16期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.16.140
  • 【分类号】S828
  • 【下载频次】25
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