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牙鲆Toll样受体1基因全长cDNA的克隆及特征分析

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【作者】 吴恋孙金生耿绪云潘宝平魏俊利王雪惠高虹

【Author】 WU Lian et al(Tianjin Key Lab.of Cyto-genetical and Molecular Regulation,College of Life Sciences,Tianjin Normal University,Tianjin 300387)

【机构】 天津师范大学生命科学学院天津市细胞遗传与分子调控重点实验室天津市水产养殖病害防治中心

【摘要】 [目的]克隆牙鲆TLR1(Toll like receptors)全长基因,并对其结构特征和表达规律进行分析。[方法]采用同源克隆和快速扩增cDNA末端技术,从牙鲆头肾组织中克隆出TLR1基因cDNA全长序列,并对该基因进行生物信息学和表达模式分析。[结果]牙鲆TLR1基因cDNA全长2 947 bp,开放阅读框(ORF)2 418 bp,编码805个氨基酸,包括26个氨基酸组成的信号肽、2个跨膜区、6个富含亮氨酸重复结构域(LRR)和一个TIR结构域(Toll/interleukin(IL)-1 receptor)。该蛋白的分子量为91.15 kDa,等电点为6.49。氨基酸序列同源性分析显示,牙鲆TLR1基因与其他脊椎动物的TLR1基因序列全长同源性达到69%~35%,TIR序列的同源性达到84%~62%。在系统发生树上牙鲆的TLR1基因首先与斜带石斑鱼聚类。通过荧光定量qRT-PCR检测,结果显示牙鲆TLR1基因的mRNA主要表达于肝脏、心脏和脾脏等组织。[结论]该研究结果为进一步研究TLR1基因的功能和开发牙鲆免疫增强剂奠定了基础。

【关键词】 牙鲆Toll样受体1(TLR1)qRT-PCR
【基金】 天津市自然科学基金(10JCYBJC09100)资助;天津师范大学博士基金(52XB1004)资助;天津师范大学市级重点实验室开放研究基金资助
【所属期刊栏目】 生物技术 (2012年26期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.26.162
  • 【分类号】S917.4
  • 【被引频次】3
  • 【下载频次】147
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