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紫花苜蓿乙酰CoA硫解酶的生物信息学分析与同源建模

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【作者】 陈建刚王海波

【Author】 CHEN Jian-gang et al(Qujing Normal University,College of Biological Resource and Environmental Science,Qujing,Yunnan 655011)

【机构】 曲靖师范学院生物资源与环境科学学院

【摘要】 [目的]对紫花苜蓿中的乙酰CoA硫解酶进行生物信息学分析与同源建模。[方法]应用生物信息学软件预测紫花苜蓿乙酰CoA硫解酶的理化性质、亲/疏水性、卷曲螺旋结构、糖基化位点、活性位点、亚细胞定位、二级结构、结构域及三维高级结构。[结果]该蛋白质是一个极疏水性蛋白,含403个氨基酸,理论等电点为6.95;包含1个明显卷曲螺旋结构、5个糖基化位点、1个硫解酶结构域;二级结构中α-helix(Hh)占39.95%、Extended strand(Ee)占16.38%、Random coil(Cc)占43.67%;Ramachandram结构检测表明预测蛋白质残基的二面角有90%以上位于黄色区域,符合立体化学能量规则。[结论]为该蛋白功能的探索提供了一定的理论参考。

【关键词】 紫花苜蓿乙酰CoA硫解酶同源建模
【基金】 曲靖师范学院生物科学重点专业建设项目;曲靖师范学院面上研究项目(2010MS007)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2012年30期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2012.30.213
  • 【分类号】S541.9
  • 【下载频次】121
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