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橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅰ)——基础分析

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【作者】 梁素钰李琳杜倩王文帆刘铁男田松岩

【Author】 LIANG Su-yu;Heilongjiang Forestry Engineering and Environment Institute,Key Laboratory of Forest Sustainable Management and Environmental Microorganism Engineering;

【机构】 黑龙江省森林工程与环境研究所,森林持续经营与环境微生物工程重点实验室

【摘要】 [目的]对开垦荒地种植橡胶草前后的土壤微生物细菌多样性进行454测序技术并对基础数据进行分析,探求利用边际土地进行战略能源作物种植的可行性。[方法]通过蛇形取样法对土壤样品采集、用试剂盒提取土壤微生物总DNA、选择细菌16SrDNA V3~V1区,进行引物设计与PCR预扩增,采用454测序技术获得数据序列并优化,用R软件进行指数多样性等基础分析。[结果]样品总DNA无蛋白质和RNA污染,PCR预扩增出500 bp左右的细菌16S rDNA。454测序序列优化序列占有效序列的90%以上,在97%相似性水平下的指数多样性显示橡胶草种植后土壤细菌OTU数目较多;Shannon-Wiener曲线和稀释性曲线显示,当测序序列细菌超过15 000时曲线趋向平坦。[结论]试验测序数据可以反应样品中绝大多数微生物信息,此次取样的数量比较合理,细菌丰富度高。

【基金】 国家林业局948,编号2013-04SC2,2011-4-51;黑龙江省财政,编号2011-02;黑龙江省森工总局,编号sgzjY2012010;黑龙江省博士后,编号LBH-Q10010
【所属期刊栏目】 生物技术 (2014年09期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2014.09.005
  • 【分类号】S154.36
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】142
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