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獭兔酪氨酸酶相关蛋白1(Tyrp1)基因序列分析及外显子多态性研究

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【作者】 郝晔施丽娟闫晓荣赵博昊朱杰陈阳翁巧琴吴信生

【Author】 HAO Ye;SHI Li-juan;YAN Xiao-rong;WU Xin-sheng;College of Animal Science and Technology,Yangzhou University;Jiangsu Key Laboratory of Animal Genetics & Breeding Design;Zhejiang Yuyao Xinnong Rabbit Industry Co.,Ltd.;

【机构】 扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物繁育与分子设计重点实验室浙江省余姚市欣农兔业有限公司

【摘要】 [目的]探索獭兔酪氨酸相关蛋白1(Tyrp1)基因在毛色形成过程中的分子机制。[方法]对獭兔Tyrp1基因序列的核苷酸序列、编码产物的基本理化性质等进行预测和分析,同时利用PCR-SSCP(Single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products)技术检测Tyrp1基因CDS序列的多态性分布状况。[结果]信息学分析发现,TYRP1蛋白是不稳定的亲水性蛋白,有信号肽,具有酪氨酸酶家族特征性功能结构域。多态性检测发现仅在Tyrp1基因CDS的483 bp处存在1个C→T的同义突变,位于外显子2上,该碱基的突变没有造成氨基酸的改变(AUC→AUT,异亮氨酸)。Hardy-Weinberg平衡检验表明,青紫蓝色獭兔群体处于非平衡状态,白色獭兔群体处于平衡状态。青紫蓝兔群体为中度多态信息含量(0.25<PIC<0.50),白色獭兔群体为低度多态信息含量(PIC<0.25)。[结论]Tyrp1基因对獭兔的毛色有一定的影响。该研究结果可为獭兔毛色的选种选育提供一定的参考。

【关键词】 獭兔Tyrp1SNPs序列分析
【基金】 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-44-1);江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD 2014-134)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2016年09期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.09.057
  • 【分类号】S829.1
  • 【被引频次】6
  • 【下载频次】104
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