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草鱼出血病分子流行病学及GCRV多样性研究

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【作者】 黄毅昌雷燕杨玉滔闫秀英简纪常吴灶和

【Author】 HUANG Yi-chang;LEI Yan;YANG Yu-tao;YAN Xiu-ying;Guangdong Key Laboratory of Pathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals,and Key Laboratory of Control for Diseases of Aquatic Economic Animals of Guangdong Higher Education Institues,Fisheries College of Guangdong Ocean University,Guangdong Ocean University;Guangzhou Liyang Aqua-Technology Co.Ltd;

【机构】 广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室/水产经济动物病害控制广东普通高校重点实验室广州利洋水产科技股份有限公司

【摘要】 [目的]分析不同基因型GCRV分离株与患草鱼出血病草鱼症状的相关性。[方法]采用RT-PCR检测患病草鱼,应用生物信息学方法分析基因型内和基因型间不同分离株间的差异。[结果]对近3年来草鱼出血病分子流行病学分析发现,患草鱼出血病病鱼多为"肠炎型"症状,且检测发现其病原多属于GCRV基因型Ⅲ型。对GCRV的多样性分析表明,不同分离株同源蛋白的同源率高达93%以上,却被给予完全不同的名称,给GCRV多样性研究带来一定的困难;同一基因型不同分离株同源蛋白间的变异位点较少,且功能位点发生变异的更少;不同基因型不同分离株同源蛋白间的保守位点较少,且这些保守位点中只有极少数位点为功能位点;不同基因型分离株同源结构蛋白间存在较大的差异,且同源非结构蛋白间的差异更为显著。[结论]草鱼出血病不同临床症状可能与其病原基因型不同有关。

【基金】 国家重点基础研究发展计划项目(2009CB118704)
【所属期刊栏目】 动物科学·饲料科学 (2016年11期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.11.041
  • 【分类号】S943
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】295
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