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菠萝蜜EST-SSR标记开发及其种质资源遗传多样性分析

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【作者】 顾洪涛李映志叶春海陈亮

【Author】 GU Hong-tao;LI Ying-zhi;YE Chun-hai;Guangdong Ocean University;

【机构】 广东海洋大学

【摘要】 [目的]分析菠萝蜜EST-SSR标记的稳定性和多态性揭示能力,并将其用于菠萝蜜种质资源遗传多样性研究。[方法]利用已获得的菠萝蜜c DNA文库中的EST序列,通过搜索SSR序列,设计引物,PCR扩增后,银染检测扩增结果。[结果]设计开发出479对EST-SSR引物,其中399对能在菠萝蜜上扩增出产物,282对具有多态性,多态性扩增引物占58.87%;从中选择60对能够清晰扩增的多态性引物,对64份菠萝蜜种质资源进行遗传多样性分析,60对EST-SSR引物共扩增出188条带,不同引物的扩增条带数在2~11,平均3.13条;其中有168条为多态性条带,多态率为89.36%;每对引物的多态信息含量(PIC)为0.407 7~0.958 9,平均PIC为0.792 2,这说明供试材料具有较高的遗传多样性。系统聚类分析结果表明,在相似系数0.688 1处,可将64份菠萝蜜种质资源分成二大类群,在相似系数0.732 5处,第二大类群又可分为4个亚群。[结论]EST-SSR标记的多态性揭示能力强,用于分析菠萝蜜种质遗传多态性的能力强,其应用前景广阔。

【关键词】 菠萝蜜EST-SSR遗传多样性种质资源
【基金】 广东省科技计划项目(2013B020304004)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2016年11期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.11.045
  • 【分类号】S667.8
  • 【被引频次】5
  • 【下载频次】136
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