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福建地区2株猪嵴病毒VP1基因的克隆及遗传进化分析

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【作者】 张永军胡永浩

【Author】 ZHANG Yong-jun;HU Yong-hao;China Agricultural Vet.Bio.Science and Technology Co.;College of Veterinary Medicine,Gansu Agricultural University;

【机构】 中农威特生物科技股份有限公司甘肃农业大学动物医学院

【摘要】 [目的]调查猪嵴病毒在福建地区腹泻猪群中的流行和变异情况。[方法]根据Gen Bank中登陆的猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKo V)结构蛋白VP1基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法从某猪场采集腹泻小肠样品中扩增猪嵴病毒VP1基因,将扩增后的目的片段克隆后进行序列测定。应用生物信息学软件,将获得的2株猪嵴病毒VP1和Gen Bank的猪嵴病毒株VP1基因序列进行对比分析。[结果]猪嵴病毒CH/FJNP/12L/2015与匈牙利株K-30-HU/2008/HUN(GQ249161)的核苷酸同源性最高,为88.1%,氨基酸同源性为95.3%。CH/FJNP/12W1/2015与越南株714441/CAOLANH-VH/2012-2-21(KT266058)的核苷酸同源性最高,为88.2%,氨基酸同源性为96.1%,同源重组分析显示,2株毒株均无明显同源重组发生。[结论]频繁的畜禽国际贸易,以及如今便捷的现代化交通工具,人们生活提供方便的同时,也加速了猪嵴病毒毒性的传播。

【关键词】 猪嵴病毒VP1基因同源性
【基金】 中国农业产业体系(CARS-39)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2016年14期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.14.052
  • 【分类号】S852.651
  • 【被引频次】1
  • 【下载频次】38
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