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玉米磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的克隆及序列分析

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【作者】 王重樊哲儒张跃强李剑峰高新

【Author】 WANG Zhong;FAN Zhe-ru;ZHANG yue-qiang;Institute of Nuclear and Biological Technologies,Xinjiang Academy of Agricultural Sciences;Key Laboratory of Crop Ecophysiology and Farming System in Desert Oasis Region,Ministry of Agriculture;

【机构】 新疆农业科学院核技术生物技术研究所农业部荒漠绿洲作物生理生态与耕作重点实验室

【摘要】 [目的]获得玉米的PEPC基因,并对其生物信息学进行分析。[方法]使用RT-PCR方法由玉米中获得PEPC全长c DNA,构建克隆载体后进行测序,并对其序列进行生物信息学分析。[结果]获得的玉米PEPC基因CDS全长2 913 bp,编码的多肽链包含970个氨基酸,为疏水性氨基酸,由α-螺旋(61.44%)、无规则卷曲(34.43%)和延伸链(4.12%)组成,定位于细胞质,不存在跨膜结构域,其175970位氨基酸组成了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的功能结构域,在173184、597609位具有2个磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶活性位点。[结论]该研究克隆了玉米C4型丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因,它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域。

【基金】 新疆农业科学院青年基金项目(xjnkq-2013025)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2016年20期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2016.20.037
  • 【分类号】Q943.2
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】110
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