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黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)扩增引物筛选及初步应用

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【作者】 宗凯赵营莉周莉质李秀秀宫鹏夏泉

【Author】 ZONG Kai;ZHAO Ying-li;ZHOU Li-zhi;XIA Quan;Anhui Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University;

【机构】 安徽出入境检验检疫局安徽医科大学第一附属医院药剂科安徽省海王医药有限公司

【摘要】 [目的]建立并优化黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术扩增反应体系,对中药材黄芪甲基化水平进行研究。[方法]磁珠法提取黄芪DNA后,采用Hpa II/Msp I 2种内切酶进行酶切,将酶切产物加上连接接头序列,经预扩增和选择性扩增反应,最终从黄芪MSAP的256对引物中筛选出最佳分辨引物4对。应用筛选到的4对引物,分析12种不同产地黄芪的甲基化模式,并对甲基化水平聚类分析。[结果]经MSAP检测12个黄芪样本半甲基化率在12.5%~26.7%,全甲基化率在25.6%~51.1%,总甲基化率在48.7%~73.5%,总体上黄芪样本的全甲基化率大于半甲基化率。采用NTSYSpc软件对黄芪样品Hpa II和Msp I多态性数据进行分析,获得UPGMA聚类图和主成分分析PCA图。[结论]MSAP技术能够很好地用于黄芪的甲基化分析,结合NTSYSpc软件能对不同产地黄芪之间甲基化水平进行聚类分析,且初步分析结果表明从UPGMA和PCA图上来看,地区相近的单株聚类分析表现出了一定的地域性。

【基金】 国家质检总局科技计划项目(2015IK001)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2017年29期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2017.29.045
  • 【分类号】Q943.2;S567.239
  • 【下载频次】111
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