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空肠弯曲菌flaA基因序列及功能预测分析

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【作者】 訾臣曾德新蒋鲁岩袁飞蒋原薛峰

【Author】 ZI Chen;ZENG De-xin;JIANG Lu-yan;APFIC,Jiangsu Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau;College of Veterinary Medicine,Nanjing Agricultural University;

【机构】 江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心南京农业大学动物医学院中国检验检疫科学研究院上海出入境检验检疫局

【摘要】 [目的]对空肠弯曲菌空肠弯曲菌flaA基因的序列及功能进行预测分析。[方法]分析了多个空肠弯曲菌flaA核酸及氨基酸序列组成和序列差异性;预测分析了flaA基因密码子使用偏好性、蛋白结构和功能域、Fla A与相关功能蛋白的互作情况。[结果]不同菌株的flaA基因序列存在差异性,且差异主要存在于序列的中间区域。不同空肠弯曲菌菌株的同一基因在密码子选择上存在差异。Fla A与多个蛋白存在不同形式的相互作用。[结论]该研究可为空肠弯曲菌flaA基因序列分析和功能研究应用提供基础和依据。

【基金】 国家质量监督检验检疫总局科技计划项目(2016IK131);江苏省出入境检验检疫局科研项目(2017KJ46);南京农业大学科研资助项目(804121);质检公益性行业科研专项(201510038)
【所属期刊栏目】 生物技术 (2017年32期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2017.32.050
  • 【分类号】R378
  • 【下载频次】74
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