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2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性分析

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【作者】 王鹏飞高欢欢苏玲蒋锡龙吴新颖杨立英任凤山王咏梅

【Author】 WANG Peng-fei;GAO Huan-huan;SU Ling;Shandong Grape Research Institute;

【机构】 山东省葡萄研究院

【摘要】 [目的]分析2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性。[方法]利用Codon W1.4计算密码子偏好性参数的相关参数。[结果]2种果蝇线粒体中蛋白编码基因的AT含量比GC含量更高。D.sechellia的线粒体基因组的密码子偏好性比黑腹果蝇D.melanogastera的线粒体基因组的密码子偏好性略强。2种果蝇线粒体基因组中各蛋白编码基因CDs中,RSCU值大于1的密码子都是以A或U结尾,而并不以C或G结尾。2种果蝇线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因簇基因的密码子偏好性都可能受到突变压力影响。D.melanogaster线粒体基因组中不存在密码子CGC。NADH dehydrogenase subunit 3基因的密码子偏好性可能比其他NADH dehydrogenase subunit基因更高。此外,尽管大部分NADH dehydrogenase subunit基因偏爱使用A或U结尾的密码子,但是在NADH dehydrogenase subunit 6基因中,有2个AU结尾的密码子(AGA、GCA)的RSCU也为0。[结论]该研究结果为2种果蝇线粒体的进化研究提供了新观点。

【基金】 山东省农业重大应用技术创新项目“特色酒用葡萄产期精准调控与产品创新研究应用”;山东省农业重大应用技术创新项目“山东葡萄酒地标性酒种开发与关键技术集成应用”;山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2016D01)
【所属期刊栏目】 动物科学·生物技术 (2018年01期)
  • 【DOI】10.13989/j.cnki.0517-6611.2018.01.029
  • 【分类号】Q78
  • 【被引频次】2
  • 【下载频次】154
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