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十字花科植物DFR蛋白的生物信息学分析

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【作者】 胡燕尹明智匡光炼黄杰严秋香

【Author】 HU Yan;YIN Ming-zhi;KUANG Guang-lian;College of Biology and Agricultural Science&Technology, Zunyi Normal University;

【机构】 遵义师范学院生物与农业科技学院

【摘要】 采用生物信息学的方法分析已经在GenBank上注册十字花科植物的DFR基因序列及相应氨基酸序列,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系等进行预测。结果表明,十字花科植物的DFR蛋白大部分都有6个外显子,分子质量36 481.89~43 129.21 Da,大多数蛋白亚细胞定位于叶绿体中;除了BnaDFRA402,其他的DFR蛋白均具有酶活性部位、NADP结合位点和底物特异结合位点,这些保守区域形成了5个motifs;每个DFR蛋白均有多个磷酸化位点,以Ser为主,以Thr和Tyr磷酸化为辅;二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,其中α-螺旋为主要结构元件。

【关键词】 十字花科花青素DFR蛋白生物信息学
【基金】 国家自然科学基金项目(31501337);贵州省科学技术厅、遵义市科学技术局、遵义师范学院联合科技基金项目(黔科合LH字[2016]7014号);贵州省高层次创新型人才培养计划(遵市科合人才[2017] 11号);贵州省高等学校创新能力提升计划(黔教合协同创新字[2013]11)
【所属期刊栏目】 动物科学·生物技术 (2019年17期)
  • 【分类号】Q946.1
  • 【下载频次】181
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