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玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的克隆及表达模式分析

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【作者】 李学然毕欢欢薛江芝李路阳王欣宇刘玉卫谷守芹韩建民

【Author】 LI Xueran;BI Huanhuan;XUE Jiangzhi;LI Luyang;WANG Xinyu;LIU Yuwei;GU Shouqin;HAN Jianmin;Hebei Key Laboratory of Plant Physiology and Molecular Pathology/College of Life Science, Hebei Agricultural University;

【通讯作者】 韩建民;

【机构】 河北农业大学生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室

【摘要】 为明确玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的结构特征及其在病菌重要生长发育时期的表达模式,本试验以酿酒酵母ScMSN4氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌基因组数据库中搜索并克隆其同源基因,并对该基因的结构及其编码蛋白的理化性质、空间结构等进行预测;通过分析病菌关键生长发育阶段的RNA-Seq数据,明确该基因的表达模式。结果发现,在玉米大斑病菌基因组中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,将其命名为StMSN4;该基因DNA全长为1357 bp,cDNA全长为1296 bp,包含2个外显子,1个内含子;其编码蛋白包含431个氨基酸,含有2个典型ZnF-C2H2保守结构域。通过对病菌的菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉时等5个典型发育时期的RNA-Seq数据分析表明,StMSN4基因在5个发育时期均有表达,且表达水平较高,表明该基因在病菌的生长发育阶段发挥着重要的作用。本研究不仅明确了StMSN4基因的结构特性及其表达模式,也为深入研究该基因的功能及HOG-MAPK信号转导途径的作用机制奠定了基础。

【关键词】 玉米大斑病菌MSN4基因结构RNA-Seq
【基金】 河北省自然科学基金(C2016204164);河北省引进留学人员资助项目(CN201705);现代农业产业技术体系专项(CARS-02)
  • 【DOI】10.13320/j.cnki.jauh.2019.0072
  • 【分类号】S435.131.4
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