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枣TCP家族基因鉴定及其表达分析

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【作者】 赵一彤魏戏梦薛超玲李景刚赵锦

【Author】 ZHAO Yitong;WEI Ximeng;XUE Chaoling;Li Jinggang;ZHAO Jin;College of Life Science, Hebei Agricultural University;Baigou New Town Logistics Service Center;

【通讯作者】 赵锦;

【机构】 河北农业大学生命科学学院白沟新城物流服务中心

【摘要】 为了揭示枣TCP基因家族在枣生长发育中的作用,本文利用枣全基因组数据库搜索TCP家族基因,对该类基因进行鉴定、染色体分布等生物信息学和表达分析。结果表明,枣TCP基因家族包含22个成员,蛋白长度范围为172~590个氨基酸,等电点为4.88~5.25,全部为亲水蛋白;其中15个基因分布在6条染色体上,5号染色体最多,有4个;聚类分析发现,该类基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ2类,ClassⅡ又分为CYC/TB1和CIN亚类;组织特异性表达分析表明,该类基因主要在叶、蕾、花和果中表达;同时,植原体侵染对该类基因的表达有显著影响。蛋白互作预测发现ZjTCP和其他蛋白以及同一家族蛋白内部之间均可以发生互作。本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据。

【基金】 河北省杰出青年基金项目资助(C2016204145)
  • 【DOI】10.13320/j.cnki.jauh.2019.0098
  • 【分类号】S665.1
  • 【下载频次】29
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