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罗非鱼性别相关微卫星标记的初步筛选

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【作者】 陈文伟曹建萌刘志刚杨娜卢迈新

【Author】 CHEN Wen-wei;CAO Jian-meng;LIU Zhi-gang;YANG Na;LU Mai-xin;Key Lab of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application & Cultivation,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences;College of Fisheries & Life,Shanghai Ocean University;

【通讯作者】 卢迈新;

【机构】 中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室上海海洋大学水产与生命学院

【摘要】 为分析罗非鱼群体的遗传多样性以及筛选与罗非鱼性别相关的微卫星标记。应用24对微卫星引物,使用常规PCR及聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法在两个尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)群体和两个奥利亚罗非鱼(O.aureus)群体中初步筛选到UNH931、GM128、GM201、GM258、GM597以及UNH898共6个与性别相关的微卫星标记。然后使用降落PCR以及毛细管电泳的方法在两个尼罗罗非鱼群体、两个奥利亚罗非鱼群体以及ZY1、WY1、YY1和YY2型罗非鱼群体中进一步扩增这6个微卫星标记,统计各群体的遗传多样性参数:6个微卫星标记在上述群体共297个样本中检测到95个等位基因,其大小在97~302 bp之间,各位点在各群体等位基因数在1~13个之间,各群体平均观测等位基因数为2.167~9.333,平均有效等位基因数为1.624~4.966,平均观测杂合度为0.324~0.983,平均期望杂合度为0.329~0.782,平均多态信息含量为0.275~0.753;两个尼罗罗非鱼群体、WY1和YY2群体达到高度多态(PIC>0.5),两个奥利亚罗非鱼群体、ZY1和YY1群体为中度多态(0.25<PIC<0.5)。聚类分析显示所有群体聚为两大支,两个奥利亚罗非鱼群体以及ZY1群体聚为一支,两个尼罗罗非鱼群体、WY1、YY1以及YY2群体聚为另一支。进行性别关联分析发现:GM597与无锡尼罗罗非鱼群体、高要尼罗罗非鱼群体以及番禺奥利亚罗非鱼群体的性别显著相关,UNH898与高要尼罗罗非鱼群体的性别极显著相关。利用GM597与UNH898联合分析可100%鉴定两个尼罗罗非鱼群体的性别。利用UNH898可以100%将YY1群体与两个尼罗罗非鱼群体区分开。

【基金】 国家重点研发计划(2018YFD0901201);现代农业产业技术体系(CARS-46);国家自然科学基金(31502205);中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2017HY-ZC0601,2019ZX-003)
  • 【DOI】10.13721/j.cnki.dsyy.2020.01.004
  • 【分类号】S917.4
  • 【下载频次】170
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