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摄食不同种类饵料的鲤肝脏组织miRNA表达谱分析及验证

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【作者】 罗杰杨淞杜杰刘巧杜宗君杨世勇李胜杰赵柳兰

【Author】 LUO Jie;YANG Song;DU Jie;LIU Qiao;DU Zong-jun;YANG Shi-yong;LI Sheng-jie;ZHAO Liu-lan;College of Animal Science and Technology,Sichuan Agricultural University;Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fish Breeding & Cultivation of Chinese Academy of Fishery Sciences,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences;

【通讯作者】 李胜杰;赵柳兰;

【机构】 四川农业大学动物科技学院中国水产科学研究院珠江水产研究所热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室

【摘要】 MicroRNA(miRNAs)是一类长度为18-25nt的内源性非编码单链小RNA,参与细胞增殖与凋亡、免疫、脂肪代谢等过程。本试验以三组投喂不同类型饵料的鲤(Cyprinus carpio)肝脏为研究材料,通过HiSeq 2500深度测序技术和生物信息学分析miRNA,鉴定出235个已知miRNAs。三种饵料组共表达的差异miRNAs有13个,随机挑选5个miRNA并采用qPCR进行验证,表达趋势在qRT-PCR结果和RNA测序结果中高度相似;对13个共表达的差异表达miRNAs进行靶基因预测,共预测到靶基因530个。对预测靶基因进行KEGG通路分析,结果显示参与2-羰基羧酸代谢,糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚定生物合成,柠檬酸循环(TCA循环)等通路的调节。本研究首次了解鲤摄食不同种类饵料的miRNAs表达特征,可以为深入了解miRNA对鲤摄食不同种类饵料过程的调控作用奠定基础。

【基金】 国家大宗淡水鱼产业技术体系建设项目(CARS-45-04);中国水产科学研究院院本级基本科研业务费专项
  • 【DOI】10.13721/j.cnki.dsyy.2020.01.005
  • 【分类号】S917.4
  • 【下载频次】90
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